کاربرد شبکههای تلفیقی به منظور برازش شبکه تنظیم بیان ژنی مؤثر بر رشد ماهیچه اسکلتی در گاو
نویسندگان
چکیده مقاله:
فناوری توالییابی رونوشتهای سلولی ابزار قدرتمندی در جهت تجزیه و تحلیل رونوشتهای سلولی، در بسیاری از زمینههای تحقیقاتی میباشد. در سالهای اخیر پیادهسازی شبکه جهت بررسی روابط بین ژنها با استفاده از دادههای حاصل از این فناوری به درک بهتر سازوکارهای پیچیده فیزیولوژیکی کمک نموده است. در این مطالعه به ساخت شبکه تنظیم بیان ژن و مطالعه روابط بین ژنهای دخیل در تشکیل و رشد بافت ماهیچه اسکلتی به کمک توالییابی رونوشتها در بافت ماهیچهای در حال رشد، پرداخته شده است. این پژوهش با پیادهسازی شبکه تلفیقی بر روی دادههای ذکر شده، شش فاکتور رونویسی دخیل در تشکیل و رشد بافت ماهیچه اسکلتی را معرفی کرده است. این شش فاکتور رونویسی عبارتند از KLF4 ،FOXM1 ،FOS ،MYBL2 ،KLF10 و FOSB. نقش این فاکتورهای رونویسی در فرایندهایی مانند تکثیر سلولهای بنیادی و تمایز آنها، افزایش طول و امتزاج سلولهای ماهیچهای، تکمیل مرحله تمایز و امتزاج سلولهای فیبر ماهیچه و تولید میوفیبر و کمک به حفظ خاصیت خودزایایی در سلولهای بنیادی بافت ماهیچه اسکلتی مشخص شده است. هستیشناسی مربوط به این فاکتورهای رونویسی و ژنهایی که بیانشان تحت تأثیر این فاکتورهای رونویسی تغییر میکند، نشان داد که این ژنها در مسیرهای تولید هگزوز و نوکلئوتیدها فعال هستند. این ژنها در تنظیم فعالیتهای پایهای سلول مانند تنظیم بیان ژن و رونویسی نیز دخالت داشتند. از این ژنها میتوان به عنوان نشانگر مرتبط با افزایش تولید گوشت در برنامههای اصلاح نژادی بهره برد.
منابع مشابه
مطالعه شبکه ژنی موثر بر رشد ماهیچه سینه جوجه راس تحت دادههای RNA-Seq
جوجه های بومی جز مهمترین ذخایر ژنتیکی هستند که به شرایط محیطی بخوبی سازگاری یافتهاند. اما بطور معمول سرعت رشد و راندمان غذایی آنها در مقایسه با جوجههای امروزی مناسب است. مطالعات مقایسهای بین جوجههای امروزی و مرغان بومی امکان درک علل این تفاوتهای ژنتیکی را مهیا میسازد. جهت بررسی تفاوتهای ترانسکریپتومی ژنها و مسیرهای بیولوژیکی مرتبط با رشد ماهیچه سینه در دو گروه مرغ بومی و جوجه تجاری از ...
متن کاملاثر بربرین در تنظیم آستروسیتهای Gfap+ ناحیه هیپوکمپ موشهای صحرایی دیابتی شده با استرپتوزوتوسین
Background: Diabetes mellitus increases the risk of central nervous system (CNS) disorders such as stroke, seizures, dementia, and cognitive impairment. Berberine, a natural isoquinolne alkaloid, is reported to exhibit beneficial effect in various neurodegenerative and neuropsychiatric disorders. Moreover astrocytes are proving critical for normal CNS function, and alterations in their activity...
متن کاملاثر بربرین در تنظیم آستروسیتهای Gfap+ ناحیه هیپوکمپ موشهای صحرایی دیابتی شده با استرپتوزوتوسین
Background: Diabetes mellitus increases the risk of central nervous system (CNS) disorders such as stroke, seizures, dementia, and cognitive impairment. Berberine, a natural isoquinolne alkaloid, is reported to exhibit beneficial effect in various neurodegenerative and neuropsychiatric disorders. Moreover astrocytes are proving critical for normal CNS function, and alterations in their activity...
متن کاملشناسایی بیومارکرهای بیان ژن جهت تشخیص مصرف غیر قانونی محرکهای رشد استروئیدی در کشتارگاهها
توجه به وجود باقیمانده هورمونهای محرک رشد در لاشه حیوانات کشتار شده در کشتارگاه به عنوان یک خطر بالقوه برای سلامت افراد جامعه ضروری میباشد. پژوهش حاضر با هدف شناسایی بیومارکرهایی جهت تشخیص استفاده غیرقانونی از محرکهای رشد استروئیدی در کشتارگاها انجام شد. برای این منظور در ابتدا آنالیز بیان افتراقی ژنها در یک پروفایل بیان ژنی موجود در پایگاه داده Arrayexpress با شماره دسترسی E-GEOD-12179، ش...
متن کاملایجاد سازواره های ژنی جدید به منظور بیان ژن هورمون رشد شترمرغ در سیستم های پروکاریوتی و یوکاریوتی
سابقه و هدف: رشد مناسب شترمرغ به هورمون رشد آن و تغذیه بستگی دارد. هورمون رشد شترمرغ یک پلی پپتید است که موجب تحریک رشد و تکثیر سلول ها می شود. هدف از این مطالعه همسانه سازی و تولید دو سازواره ژنی به منظور بیان هورمون رشد شترمرغ در سیستم های پروکاریوتی و یوکاریوتی می باشد. مواد و روش ها: در این پژوهش، RNA از غده هیپوفیز شترمرغ تخلیص شد و cDNA آن به روش رونوشت برداری معکوس تهیه گردید. cDNA حاصل...
متن کاملایجاد سازواره های ژنی جدید به منظور بیان ژن هورمون رشد شترمرغ در سیستم های پروکاریوتی و یوکاریوتی
سابقه و هدف: رشد مناسب شترمرغ به هورمون رشد آن و تغذیه بستگی دارد. هورمون رشد شترمرغ یک پلی پپتید است که موجب تحریک رشد و تکثیر سلول ها می شود. هدف از این مطالعه همسانه سازی و تولید دو سازواره ژنی به منظور بیان هورمون رشد شترمرغ در سیستم های پروکاریوتی و یوکاریوتی می باشد. مواد و روش ها: در این پژوهش، RNA از غده هیپوفیز شترمرغ تخلیص شد و cDNA آن به روش رونوشت برداری معکوس تهیه گردید. cDNA حاصل...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده{@ msg_add @}
عنوان ژورنال
دوره 31 شماره 2
صفحات 120- 127
تاریخ انتشار 2018-06-22
با دنبال کردن یک ژورنال هنگامی که شماره جدید این ژورنال منتشر می شود به شما از طریق ایمیل اطلاع داده می شود.
کلمات کلیدی
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023